Oracle Berkeley DB 中国研发团队的博客 » Berkeley DB XML

Berkeley DB XML 多线程添加文档例子

蔡瀛 — Mon, 01 Mar 2010 06:56:02 +0000

import java.io.File;
import java.util.concurrent.CountDownLatch;

import com.sleepycat.db.Environment;
import com.sleepycat.db.EnvironmentConfig;
import com.sleepycat.db.LockDetectMode;
import com.sleepycat.dbxml.XmlContainer;
import com.sleepycat.dbxml.XmlContainerConfig;
import com.sleepycat.dbxml.XmlDocument;
import com.sleepycat.dbxml.XmlDocumentConfig;
import com.sleepycat.dbxml.XmlException;
import com.sleepycat.dbxml.XmlManager;
import com.sleepycat.dbxml.XmlManagerConfig;
import com.sleepycat.dbxml.XmlQueryContext;
import com.sleepycat.dbxml.XmlResults;
import com.sleepycat.dbxml.XmlTransaction;
import com.sleepycat.dbxml.XmlUpdateContext;

public class DbxmlThreads extends Thread {

        public static XmlManager mgr = null;
        public static String containerName = "test.dbxml";
        public static Environment dbEnv = null;
        private static XmlContainer cont = null;

        static {
                EnvironmentConfig envConf = new EnvironmentConfig();
                envConf.setThreaded(true);
                envConf.setAllowCreate(true);
                envConf.setTransactional(true);
                envConf.setInitializeCache(true);
                envConf.setInitializeLocking(true);
                envConf.setInitializeLogging(true);
                envConf.setCacheSize(64 * 1024 * 1024);
                envConf.setLockDetectMode(LockDetectMode.DEFAULT);

                XmlManagerConfig xmlMgrConfig = new XmlManagerConfig();
                xmlMgrConfig.setAdoptEnvironment(true);

                File dbHome = new File(".");

                try {
                        dbEnv = new Environment(dbHome, envConf);
                        mgr = new XmlManager(dbEnv, xmlMgrConfig);

                        // 创建XmlContainer
                        if(mgr.existsContainer(containerName)!=0)
                                mgr.removeContainer(containerName);

                        XmlContainerConfig containerConf = new XmlContainerConfig();
                        containerConf.setTransactional(true);
                        containerConf.setAllowCreate(true);
                        containerConf.setContainerType(XmlContainer.NodeContainer);
                        cont = mgr.openContainer(containerName, containerConf);
                        cont.setAutoIndexing(false);
                } catch (Exception e) {
                        e.printStackTrace();
                }

        }

        private String name;
        private CountDownLatch doneSignal;

        DbxmlThreads(String name, CountDownLatch doneSignal) {
                this.name = name;
                this.doneSignal = doneSignal;
        }

        public void run() {
                XmlTransaction txn = null;
                try {
                        String content = "<"+name+">I am "+name+"";
                        for (int i = 0; i < 100; i++) {
                                XmlDocumentConfig dc = new XmlDocumentConfig();
                                dc.setGenerateName(true);
                                System.out.println(name+" insert "+i);
                                txn = mgr.createTransaction();

                                XmlDocument doc = mgr.createDocument();
                                doc.setContent(content);
                                cont.putDocument(txn, doc, dc);

                                txn.commit();
                        }
                } catch (XmlException e) {
                        System.out.println("insert error:" + e.getMessage());
                } finally {
                        doneSignal.countDown();
                }
        }

        public static void main(String[] args) throws Exception {

                CountDownLatch doneSignal = new CountDownLatch(5);
                DbxmlThreads threadA = new DbxmlThreads("A", doneSignal);
                DbxmlThreads threadB = new DbxmlThreads("B", doneSignal);
                DbxmlThreads threadC = new DbxmlThreads("C", doneSignal);
                DbxmlThreads threadD = new DbxmlThreads("D", doneSignal);
                DbxmlThreads threadE = new DbxmlThreads("E", doneSignal);

                threadA.start();
                threadB.start();
                threadC.start();
                threadD.start();
                threadE.start();

                doneSignal.await();

                XmlQueryContext qc = mgr.createQueryContext();
                String query = "collection('"+containerName+"')/A";
                XmlResults res = mgr.query(query, qc);
                System.out.println("The results size is: "+res.size());
                res.delete();
                cont.close();
                mgr.close();
        }

}

欢迎加入Berkeley DB群@LinkedIn

chaohuang — Mon, 22 Feb 2010 13:19:01 +0000

首先祝各位访客新年快乐，虎年富贵吉祥！

Oracle Berkeley DB在LinkedIn.com上的新建了一个群，供全球的相关人士（包括工程师、产品经理、客户等）共同讨论Berkeley DB的话题和业界动态。群地址：http://www.linkedin.com/groups?gid=2131985. 欢迎加入！

Oracle Berkeley DB 中国研发团队

Berkeley DB三大产品收费模式

chaohuang — Thu, 05 Nov 2009 08:21:58 +0000

众所周知，Berkeley DB是开源的，个人用户可以下载做学习、试用。但实际上，Berkeley DB是Oracle的一个产品，也是要收费的。

英文好的同学，可以读一下我们的授权申明：http://www.oracle.com/technology/software/products/berkeley-db/htdocs/licensing.html。

英文不好的同学，我在此可以稍作解释（强调：我的观点仅作参考，Oracle公司拥有最终解释权）：

1. Berkeley DB产品家族三大产品（BDB，BDB-JE和BDB-XML）都是采取双license的授权模式，即开源（免费使用）和商用（付费使用）两种模式。

2. 衡量两种授权模式的一个主要区别是 – “redistribute”，意即你是否将自己的应用程序（在你的应用中使用了BDB）发布给第三方，如客户，机构，附属机构，母公司，合作者，中间商，第三方的非营利组织等。

3. 举例子来说：

如果是个人用户做学习研究之用，可以选择开源授权，免费；

如果是个人用户在BDB上做一些应用，如果你的应用是开源发布的，可以选择开源授权（但要符合BSD、GPL等开源条款）；如果是闭源，需要选择商业授权；

如果是在公司的商用项目使用，需要选择商业授权，即付费；

如果大家再有问题，或者不确定，欢迎留言。版权保护，也是保护到每个IT从业人员。

—

附件： Oracle官方网站给出TimesTen和Berkeley DB 产品家族在美国市场参考价格（见下图）。

Berkeley DB 价格清单

关于Oracle产品的价格清单，请浏览官方网址: http://www.oracle.com/corporate/pricing/pricelists.html.

注意：价格仅作参考，Oracle公司拥有最终解释权。

甲骨文中国(包括Berkeley DB)2010校招日程

chaohuang — Thu, 15 Oct 2009 06:37:50 +0000

2010财年甲骨文(中国)校园招聘大致流程：
校园宣讲 -> 在线申请 -> 在线测试（涵盖：技术、性格、英文等）-> 初步筛选 -> 邀请合格同学on-site 笔试和面试 -> 进一步筛选 -> 发offer

校园宣讲会初步日程（注意：日期及时间请以51job和校园广告为准）：

Oct. 19th Shanghai Tongji Univ. (19:00-21:00)
Oct. 20th Shenzhen HIT Graduate School (19:00-21:00)
Oct. 21th Guangzhou Southern China Univ. of Tech. (15:00-17:00)
Oct. 26th Beijing Tsinghua Univ. (19:00-21:00)
Oct. 27th Wuhan Huazhong Univ. of Science and Tech. (19:00-21:00)
Oct. 30th Hangzhou Zhejing Univ. (19:00-21:00)
Nov. 2nd Suzhou Suzhou Univ. (14:00-16:00)
Nov. 4th Nanjing Southest Univ.(19:00-21:00)
Nov. 5th Dalian Dalian Univ. of Tech. (19:00-21:00)

更新！！原计划于Nov. 6th的在线测试，因后台录入部分同学的纸质简历而推迟。新的时间安排：HR给的反馈是定在本周（Nov. 9th这周末或者周末以前），请大家留意Email通知并谅解。

注: BDB的招聘行程（此项会持续更新，期待届时与你见面交流）：

Chao Huang – 校园宣讲，Oct. 19th Shanghai Tongji Univ. (19:00-21:00)
Eric Wang – 校园宣讲，Oct. 20th Shenzhen HIT Graduate School (19:00-21:00)

今年Oracle会组织在多个城市进行面试，BDB初步决定参加下面4个。各位面试同学的时间地点请以电话通知为准。

Eric Wang – 面试官，Nov. 17-18，深圳
Linchun Sun – 面试官，Nov. 19-20，广州
Chao Huang – 面试官，Nov. 25-27，北京
Chao Huang – 面试官，Nov. 24-25，上海

采用Berkeley DB XML PHP建立原生XML Web服务器

赵汝聪 — Mon, 12 Oct 2009 05:58:39 +0000

近十年来，XML应用越发广泛，政府也推出了《基于XML的电子公文格式规范》等标准。那么，在需要XML数据库引擎的情况下，采用原生XML数据库Berkeley DB XML(以下简称BDB XML)取代MySQL(或其它传统DB)做后台数据库是一个更好的选择。

BDB XML是Oracle推出的一款开源原生XML数据库。与传统数据库相比，原生XML数据库的优势有：
1. 可以直接操作XML文件，XML数据无损–在某些场合，无损的数据源意味着法律效力。
2. 原生检索方式，支持XQuery和XPath，符合XML习惯。
3. 性能优化：原生XML数据库会针对XML特点进行各种优化，如插入文档索引、建立节点ID等。
4. 支持相同数据的不同视图。

和其它原生XML数据库相比，BDB XML优势有：
1. 完整的ACID 事务处理、自动恢复、热备份、用于分布式事务的HA支持。
2. 支持XQuery(含XQuery Update)和XPATH。
3. 可以利用其特有的二进制元数据存取大容量二进制对象(非XML数据)。
4. 支持全Unicode字符集，中文存储、查询都不成问题。
5. 提供一套容器和迭代器接口访问和操作查询结果。
6. 提供交互式命令行工具。

以上第三点是一个非常实用的特性，某种程度上它补足了XML应用的”最后一公里“：比方说，你正在为教育部门开发一个考生管理数据库，需要将考生的资料存成XML文档，那么存取照片(二进制数据)就相当麻烦。一般来讲传统的选择有两种：一是转换为Base64Binary格式嵌入到XML文档中，这意味着存取两端都需要转换大量图片数据，效率就很低下;二是为每个照片生成一个引用再另存它处，只在XML文档中保留一个引用，这种方法不但复杂，而且把数据从文档中分割了出来，损失了ACID特性，管理不便。而使用BDB XML就可以将照片数据直接以二进制元数据的形式嵌入到XML文档中，存取都非常方便，还可以基于数据库实现图像/视频检索。

下面，介绍一下BDB XML PHP的安装过程：

安装Apache+PHP环境

好吧，这是一个烂大街的话题，网上一抓一大把。下面以Debian 5.0和apache2为例：
用aptitude安装以下软件包：

apache2
libapache2-mod-php5
php5
php5-dev
php5-cgi

安装完毕。启动Apache服务器：

sudo /etc/init.d/apache2 start

测试一下是否安装成功，首先找到http的根目录(本机环境是/var/www)，在该目录下生成php测试文件test.php(内容如下)：

用浏览器打开网页服务器的test.php，如果安装成功，会打开php信息页。

安装BDB XML PHP

移步http://www.oracle.com/technology/software/products/berkeley-db/xml/index.html下载源码包dbxml-2.5.13.tar.gz，并放置在$HOME目录下。下面以Linux上的安装为例：

cd $HOME
tar zxf dbxml-2.5.13.tar.gz
cd dbxml-2.5.13
./buildall
cd db-4.8.24/php_db4
phpize
./configure --with-db4=$PWD/../../install
make
sudo make install
cd ../../dbxml/src/php/
phpize
./configure --with-dbxml=$PWD/../../../install
make
sudo make install

接下来编辑/etc/php5/apache2/php.ini和/etc/php5/cgi/php.ini文件(可能路径略有不同)，把以下两行加到Dynamic Extensions段：

extension=db4.so
extension=dbxml.so

大功告成，为保安全，最好重启一下Apache服务器。到此BDB XML PHP全部安装成功。在实际应用中，需要特别注意帐户和权限问题：要保证Apache的运行帐户对容器(Container)文件及其所在目录有读写权限。

范例

从开心网的群共享页面http://www.kaixin001.com/group/file.php?gid=627784&fid=450163&start=0下载附件xmlData.tar.gz，解压后，将xmlData目录下的所有文件拷贝到http根目录下，然后执行：

./gen_cont.sh $HOME/dbxml-2.5.13/install/bin/dbxml

脚本即会生成一个容器：simple.dbxml。该容器内包含三百多个xml文档，形如：


<产品>
    <种类>fruits
    <商品>Avocado
    <存货>
        <库存量单位>AvocfruijfHs18
        <价格>0.24
        <存货>393
    
    <厂家>Simply Fresh

使用浏览器访问服务器上的simple.php页面，即可看到转换后输出的数据表。simple.php的内容如下：



createQueryContext(); // Query Context
$qc->setDefaultCollection($contName); // 设置默认Container

// 打开Container
$cont = $mgr->openContainer($contName);

// 创建XQuery查询表达式，将数据提取出来并转换为html表格
$query = 'for $产品 in collection()/产品';
$query .= ' return ';
$query .= '{$产品/种类/string()}';
$query .= '{$产品/商品/string()}';
$query .= '{$产品/存货/价格/string()}';
$query .= '{$产品/存货/存货/string()}';
$query .= '{$产品/厂家/string()}';
$query .= '';

// 输出表格头
?>query($query, $qc);
while ($results->hasNext())
echo $results->next()->asString();

// 输出表格尾
?>
种类 商品 价格 存货 厂家

可见，只需30余行的代码就能完成xml数据库到网页表格的转换。例图：

总结

至此，我们已经介绍了BDB XML PHP的安装和使用。至于更多BDB XML功能，如二进制元数据、环境、事务、排序、索引等，请关注后续文章。

Berkeley DB (中国)2010校园招聘

chaohuang — Wed, 23 Sep 2009 06:45:55 +0000

重要：关于招聘的最新信息，请看：Oracle 2010 校招日程

各位2010届的毕业生同学，你们好！

你喜欢编程，擅长算法吗？你有志于开发数据库内核吗？欢迎你申请加入Berkeley DB全球研发团队。

关于我们及职位要求（见下图）：

职位要求

Berkeley DB的全球客户（部分）：

商业客户

开源应用

重要! 如何申请：

我们将和Oracle其他部门一起，以校园招聘形式来进行。请大家届时留意本博客和Oracle的校园宣传广告、BBS等，然后登录Oracle的在线系统进行申请(网址：http://campus.oracle.cn)。申请时，请选择”Software Developer”, 并在系统注明你申请的是Oracle Berkeley DB（也作DB）开发工程师。

今年我们组的招聘名额是4个，地点在深圳。校园宣讲初步定于2009/10月。

小奖品

chaohuang — Tue, 22 Sep 2009 03:11:56 +0000

大家好！

BDB小礼物 – 若干2GB U盘（带Oracle Logo）

最近留意到我们BDB中国社区算是小有人气了，我们开发人员也十分开心。在此也感谢大家的支持。

我很努力争取到了一些U盘，用来奖励有兴趣为BDB做点事情的朋友。礼物虽不贵重，但希望大家理解，实是我们的一片心意。由于数量有限，先到先得吧。

重在人人参与

BDB的3个产品都是开源的，大家可以下载并研究源代码。有心的开发者，也可以把你自己写的示例程序、文章、使用心得、创意等发给我（chao.huang at oracle dot com）。每个入围的朋友都可以收到我们寄出的小奖品，并且获奖者会在bdbchina blog上公布。

我们鼓励每个人的参与，和大家分享你的才智，共同进步。同时，也期待能出现眼前一亮的创意(idea)，实现自己的事业成功。比如，由于BDB的非关系型数据库的特性，它很适合于用作基因测序等方面数据（基因节点，序列图等）的管理、在医疗监控仪器（大型仪器，小型的传感器等）等应用，等等。

Berkeley DB Xml 2.5 新特性详解一：概述

蔡瀛 — Tue, 15 Sep 2009 10:15:30 +0000

2009年9月14日，Berkeley DB Xml 发布了最新的2.5版本 (包含最新发布的Berkeley DB　4.8版本)，此版本增加了新功能，并对上一个版本的所有bug进行了修复，是一个更快更加稳定的版本，推荐大家升级。下载地址在:http://www.oracle.com/technology/software/products/berkeley-db/index.html。 Berkeley DB Xml 2.5 新特性主要有一下几个方面：

1. 自建索引
2. 在wholeDocument存储模式下的压缩存储
3. Debugging API 和 debug 命令
4. 用户自定义XQuery external 函数
5. XmlResults 增强
6. 更高效的节点存储模式

接下来我们具体了解一下这些新特性：

1. 自建索引

自建索引是Berkeley DB Xml 2.5版的重大改进之一，他的主要功能是自动建立索引无需用户手动添加。在Berkeley DB XMl 2.5中，如果对XmlContainer打开了自建索引功能（通过XmlContainer.setAutoIndexing()方法或者XmlIndexSpecification.setAutoIndexing()方法），当发现有新的叶子element结点或叶子attribute结点时，XmlContainer会对新的结点增加两个索引。这两个索引分别是node-*-equality-string 和 node-*-equality-double(*表示结点名字)，在默认情况下自建索引功能是被打开的。

下面我们来看一个列子，看自建索引是如何生效的

ying@bdbcn3:~$ dbxml

dbxml> createcontainer test.dbxml
Creating node storage container

dbxml> putdocument 1.xml "test" s
Document added, name = 1.xml

dbxml> listindex
Index: node-element-equality-string node-element-equality-double for node {}:a
Index: node-attribute-equality-string node-attribute-equality-double for node {}:att1
Index: node-element-equality-string node-element-equality-double for node {}:b
Index: unique-node-metadata-equality-string for node {http://www.sleepycat.com/2002/dbxml}:name
4 indexes found.

2. whole document 模式压缩存储

在Berkeley DB Xml 2.5中对whole document存储模式添加了压缩储存功能。经过压缩可以提高文档的储存速度和降低存储空间大小。默认情况下使用unix系统的zlib进行压缩和解压，用户也可以使用自己的压缩和解压缩算法（通过实现XmlCompression接口）。

经过测试，在存储100万个4k大小的文档的XmlContainer,启用压缩的大小为398，516k，不使用压缩的大小为893，500k，可以节省大约55%的空间。

ying@bdbcn3:~$ du -sk *.dbxml 398516 Compressed.dbxml 893500 Uncompressed.dbxml

如果用户需要使用自己的压缩算法，可以实现XmlCompression接口，主要实现compress()方法用于压缩，decompress()方法用于解压缩。具体例子请参考安装包中example/cxx/misc/compression.cpp或者后续文章。

3. Debugging API和debug命令

DB XML shell 增加了一个debug命令，启动shell后键入debug命令会进入debug模式，可以用来调试XQuery语句。

例子：

dbxml> debug "collection('test.dbxml')/root/a" debug> help Command Summary --------------- backtrace - Prints a stack trace of the currently evaluating query break - Sets a break point breakpoints - Lists the break points set continue - Continues execution of the query disable - Disables the break point indentified by the numeric argument enable - Enables the break point indentified by the numeric argument optimizeFocus - Enables or disable focus optimisations frame - Changes the current frame help - Print help information. Use 'help commandName' for extended help lazy - Enables or disable lazy evaluation optimisations list - Prints the query at the current frame next - Skips query execution to the end of the current sub-expression projection - Enables or disable document projection optimisations query - Executes a query in the context of the current frame queryplan - Prints the query plan for the expression at the current frame quit - Exits the debugger run - Runs the query. If the query is already running it will be re-started step - Skips query execution forward one sub-expression debug> run test Query completed.

Debugging API调用是通过实现XmlDebugListener接口，实现此接口的各个方法可以监控XQuery执行的每个过程。Debugging API的使用可以参考example/cxx/misc/debug.cpp或者后续文章。

4. 用户自定义XQuery externl函数

新增加的XmlExternalFunction类允许用户使用C++，Java或者Python实现XQuery的external函数( 什么是XQuery external 函数)。用户只需要继承XmlExternalFunction，并实现execute()方法。 execute()方法中包括了用户需要实现函数的功能。具体例子请参考包含于发布包的example/cxx/misc/extrenalFunction.cpp, 或者这篇文章。

5. XmlResults增强

XmlResults类增加了三个方法，用来操作“离线”的XmlResults对象。
a.XmlResults.asEventWriter(), 可以通过这个方法创建一个XmlEventWriter对象。用这个XmlEventWriter对象可以向XmlResults中写入数据创建自己需要的XmlResults

b.XmlResults.copyResults(), 通过这个方法可以拷贝生成一个持久的XmlResults对象，不会因为container关闭而失效。
c.XmlResults.concatResults()，通过这个方法可以把两个XmlResults对象连接起来形成一个新的XmlResults对象，当然返回的对象也和container的生命周期无关。
具体的使用可以参考后续文章。

6. Node存储模式增强

改进了node储存的算法，使得在node储存的模式下XmlContainer的文件大小进一步减小。

结束语

Berkeley DB Xml 2.5版是一个更好更快的版本，本系列文章将会对前5个新特性一一通过例子说明，谢谢各位同学关注。

BDB产品家族在生命科学的应用

chaohuang — Fri, 28 Aug 2009 07:54:32 +0000

大家好，

在今年上半年，我们国家推出了一项7,000亿人民币的医疗改革方案，针对我们IT业界可谓影响很大。近期，我也关注到国内从事生命科学、医疗卫生等方向的一些IT的大动作。我想，在此从嵌入式应用的方向，和大家分享我的一些体会和心得。

- 生命科学中应用

我们的观察：

发现一味新药通常历时8-12年，涉及到庞大的数据量(来自美国辉瑞的反馈：1,000,000种配比; 若干TB的数据量，1 TB约合2,000张CD光盘信息)

新药研究可以是跨多个组织的合作行为，彼此共享数据 – 全球各地的临床研究机构，风险合资公司等

监管机构要求对数据严格管理和控制

数据安全，访问控制，审计，保存，审批，变更，搜索，来自相关规定和标准作业程序的要求

而违规的代价非常高 – 想象一下三鹿奶粉？

需要经济且可靠的数据管理方式，贯穿于每一个步骤和阶段

需要简单易用的，自适应的软件；倾向于“本地化”数据管理方案

个性化功能实现也需要基于一套高可靠的数据管理软件之上

很多的分析仪器和不同分析技术不间断地产生数据

仪器产生的数据直接写到文件系统，从而容易产生错误和数据丢失

没有标准化的数据格式：每台仪器连着一台独立的计算机

搜索分散于这些独立仪器中的数据几乎是不可能的

越来越多的实验室笔记的电子化

BDB等嵌入式数据库引擎的可能使用场合：

替换文件系统

工作流引擎，及多系统共享数据

非结构化/半结构化的数据

各种不同的格式和需求 – XML, Java, 脚本, 文档, 图像等

脱机工作下的数据缓存(如实验室的电子记录，片剂及其他原始数据)

“物化视图”各种来源的数据 – Materialized View, 数据缓存

器械本身需要数据管理 - 对比文件系统，具有更高的可靠性

强调软件安全和测试 - Berkeley DB发布版包括完整的测试套件，能够轻松地制定和执行您的测试

可移植性 - Berkeley DB 运行于几乎所有的嵌入式平台

Berkeley DB和其他Oracle技术的无缝集成

举例子来说：

在你医疗分析仪器（光谱，色谱等），可以用BDB来存取数据，保证效率和容错。

在你的医疗影像仪器上和医生的门诊系统上，可以用BDB来缓存你的DICOM数据，和后端的Oracle 11g DICOM数据库集成。

在很多仪器上的配置、管理的信息 – 通常是XML格式的，可以用到BDB-XML。

在临床、基因科学等研究系统里，可以用BDB-JE 的DPL API来定义基因图片上的Object-Relationship的信息，建立高效的持久化和数据可视化方案。这方面，国外已经有在做了。

等等

- 医疗卫生方面的应用

我们的观察：

各个国家在此方面投入在GDP比重呈快速增长态势：以美国为例，1990年比重为11%，到2005到15%。

老龄化趋势：据估计，中国到2025，超过65岁的人口达1.85亿；比2002年大约要翻一倍

慢性病人群快速增加：肥胖、糖尿病、心脏病等

医疗信息呈现信息化、分散化、个性化趋势：各种信息化的诊断仪器、电子病历、个人守护仪器、个人健康传感器、远程医疗等等

BDB等嵌入式数据库引擎的可能使用场合：

诊断仪器上

个人健康感应仪器和与之链接的个人PDA上

医生的诊断系统

远程医疗系统

医疗数据按区域集中（按省、区等）的“云计算”系统中

等等

举例子来说：

对照上面，不用我说了吧？

Web2.0等技术成就了Facebook、Twitter等成功。面对下一个10年，当人们生活质量提高，对医疗卫生的服务也越来越高要求，个性化监控、诊疗和健康数据的de-centralization看来是个不可避免的趋势。你觉得呢？

写了这么多，希望能大家一些启示。欢迎反馈。

Berkeley DB Xml 入门系列之三：使用Berkeley DB Xml Shell

赵汝聪 — Mon, 24 Aug 2009 09:39:23 +0000

1. 简介

Berkeley DB Xml Shell(以下简称DbXml Shell)是包含在发行包里的工具，可运行于UNIX家族平台(Linux, Solaris, HP-UX, Mac OS, Cygwin, AIX, FreeBSD…)和Windows平台上。DbXml Shell包含Berkeley DB XML的绝大多数常用功能，可以让我们在不编写一行代码的情况下，通过指令快速完成多种常用操作如创建/删除容器、插入/删除文档、查询、验证Query Plan等等，实为居家旅行必备佳品。要是在周五下午遭受紧急任务袭击，就更得靠它来拯救周末了。有时为了解决开发中遇到的问题，只要写一个非常简短的DbXml Shell脚本就可以实现预期功能或是重现环境，极大地提高了劳动生产率。

在使用DbXML shell之前，应当正确编译好Berkeley DB Xml库。具体编译过程请参考博客上的相关文章：

Berkeley DB Xml 入门系列之二：在Linux下编译和使用Berkeley DB Xml

使用Visual C++ 2008 Express Edition 编译Oracle Berkeley DB XML

2. 运行

UNIX下的可执行文件为/install/bin/dbxml，Windows环境下为/bin/dbxml.exe。钻进DbXml Shell以前，先瞄一眼说明(中文是翻译的，发行版是E文的)

rucong@debian:~/dbxml/install/bin$ ./dbxml –?

选项:

-c 在-h选项所指定的路径中创建一个新的Berkeley DB环境。

-h 使用指定的路径作为Berkeley DB环境(默认为当前路径)。

-P 设置数据库的密码

-s

Oracle Berkeley DB 中国研发团队的博客 » Berkeley DB XML

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采用Berkeley DB XML PHP建立原生XML Web服务器

安装Apache+PHP环境

安装BDB XML PHP

范例

总结

Berkeley DB (中国)2010校园招聘

小奖品

Berkeley DB Xml 2.5 新特性详解一： 概述

1. 自建索引

2. whole document 模式压缩存储

3. Debugging API和debug命令

4. 用户自定义XQuery externl函数

5. XmlResults增强

6. Node存储模式增强

结束语

BDB产品家族在生命科学的应用

- 生命科学中应用

- 医疗卫生方面的应用

Berkeley DB Xml 入门系列之三： 使用Berkeley DB Xml Shell

1. 简介

2. 运行

Berkeley DB Xml 2.5 新特性详解一：概述

Berkeley DB Xml 入门系列之三：使用Berkeley DB Xml Shell